药物的作用靶位是什么？
这个“靶”并不是具体某个结构，而是指能够影响药物与受体或酶相互作用的位置。在蛋白质的分子中存在着许多可以引起药物作用的区域（图1）。这些区域叫做蛋白的疏水区域、极性区域和环状区。 其中疏水区域(hydrophobic region)又分成4个亚区——alpha-helix（α-螺旋）、beta-sheet（β片层）、beta-turn（β弯折）和loop（圈）。这4个亚区的结构不同，对药物的作用方式也有差别。
以神经递质为例子，乙酰胆碱（ACh）是通过α-氢与胆碱酯酶结合产生抑制作用；而青蒿素通过抑制线粒体功能从而阻碍了细胞内乙酰辅酶A的生成，进而抑制了核酸和蛋白的合成。
有些药物可以通过离子通道发挥作用。在这种情况下，药物的“靶点”就是位于细胞表面的离子通道。例如，钾离子通道阻断剂乙胺碘呋酮（amiodarone）能阻止钾离子从细胞外进入细胞内，进而导致心跳停止。
某些药物作用于病毒的蛋白或病毒本身。这个时候，药物的作用位置是病毒的颗粒外壳。
还有一些药物通过干预细胞的信号传导通路发挥药效。这种情况下，药物作用的“靶标”可以是细胞膜上的受体蛋白，也可以是存在于细胞内的信号分子如钙离子、cAMP等。目前发现能够直接干预信号通路的药物比较少，大多属于后一种情况，即通过调节细胞内的第二信使来影响基因的表达从而起到治疗作用。